云南省农业科学院农产品加工研究所根据省编办《中共云南省机构编制办公室关于调整省农业科学院机关及下属事业单位机构编制的批复》（云编办〔2016〕87号）文件批准成立，为云南省农业科学院二级独立事业法人预算单位。